Cílem think tanku ISEA je posilování společenské debaty o klíčových tématech, které souvisejí se zakotvením české společnosti v západoevropském a euroatlantickém civilizačním prostředí v období, kdy většina vyspělých zemí uskutečňuje přechod ke vzdělanostní ekonomice („knowledge based economy“).
ISEA přispívá k formování politicky nezávislého a intelektuálně kriticky zaměřeného prostředí pro formulaci cílů a nástrojů uskutečňování transformačních kroků nezbytných k tomu, aby Česká republika fungovala v EU jako ekonomicky konkurenceschopná, sociálně soudržná, kulturně otevřená a politicky důvěryhodná a stabilní země, jejíž dynamika se opírá v prvé řadě o růst významu lidských zdrojů a znalostního kapitálu v prostředí otevřené společnosti. Zkušenosti z malých a přitom dnes velmi úspěšných evropských zemí ukazují, že úspěšný obrat tímto směrem není možný bez konsensu dosaženého napříč politickým spektrem, odbory a občanskou společností.
Česká republika se zatím vyznačuje spíše opačnou tendencí: věcné problémy se ideologizují, politické strany se vymezují na tématech, které by je měly spíše spojovat, velmi slabé vazby se budují mezi politickou reprezentací, akademickou obcí, profesními sdruženími a občanskou společností. Cílem think tanku ISEA je přispět i k tomu, aby se tyto vazby posílily a význam věcného argumentu v politické i veřejné diskusi vzrostl.
Tento cíl se think tanku ISEA dnes daří naplňovat dlouhodobou přítomností na české veřejné scéně, kdy si profesionální prací a soustavným úsilím o veřejnou prezentaci výsledků vybudoval pozici přirozené autority v různých otázkách společenské debaty. Think tank ISEA si postupně buduje tradici nestranné, nezávislé a odborně fundované instituce, která bude sloužit jako opora občanské společnosti a jako přirozený oponent často nekonzistentních návrhů přicházejících jak z politických stran, tak ze státní správy.
ISEA spojuje názorově a politicky různě orientované badatele. Úlohou ISEA je nejen kreativně přinášet nové myšlenky, ale především nabízet řešení. Výzkum, analýza, angažovanost a zapojování do veřejné debaty probíhá v think tanku ISEA nezávisle na politických stranách. Je však důležité, aby výsledky bádání byly převoditelné do politické debaty a následně pak i legislativních záměrů a aby se tyto výsledky prostřednictvím politických stran dostaly do podoby zákonů a dobrých reforem této země.
Mezinárodní charakter si think tank ISEA získal mimo jiné i díky spolupráci zakladatelů prof. Petra Matějů, Ph.D, Doc. ing. Jiřího Večerníka, CSc. a Doc. MPhil. Ondřeje Schneidera, Ph.D. se zahraničními partnery, mezi něž patří špičkoví vědci v oborech působnosti think tanku ISEA (Dr. T. Scott Murray, ředitel sekce statistiky práce a sociálních věcí Statistics Canada, Prof. Robert M. Hauser, člen Americké akademie věd a Filozofické společnosti, Prof. Josef A. Mestenhauser a Prof. Byron J. Schneider z Minnesotské univerzity, Prof. Nicholas Barr z London School of Economics and Political Sciences, a další.